1、长江镇（如皋港开发区）：如皋港是独立开放的国家一类口岸，位于如皋南端，长江北岸，与张家港市隔江相望吴窑镇。是如皋的副中心城市。镇政府驻原长江镇长江东路8号。总面积122.09平方公里。

2、白蒲镇：位于如皋东南部，镇政府驻原白蒲镇松杨社区蒲盛路1号吴窑镇。总面积144.89平方公里。

3、磨头镇：位于如皋中部地区，镇政府驻磨头社区卓吾路1号吴窑镇。全镇总面积102.8平方公里。

4、江安镇：位于如皋西南部，镇政府驻原江安镇府前街166号吴窑镇。总面积118.36平方公里。

5、搬经镇：地处如皋西大门，镇政府驻原搬经镇绘园路3号吴窑镇。总面积174.85平方公里。

6、石庄镇：石庄镇位于如皋西南部，是如皋市西南部政治、经济、文化的中心城镇吴窑镇。镇政府驻原石庄镇沿河北路188号。总面积85.06平方公里。

7、东陈镇：位于如皋市区东郊，镇政府驻原东陈镇府前街4号吴窑镇。总面积112.32平方公里。

8、丁堰镇：地处如皋东大门，镇政府驻地三河社区环西路1号吴窑镇。总面积70.48平方公里。

9、下原镇：地处如皋中南部，镇政府驻地下原社区康园南路吴窑镇。全镇总面积70.76平方公里。

10、九华镇：位于如皋南端，以境内九华山得名，镇政府驻九华社区政府路1号吴窑镇。总面积78.30平方公里。

11、吴窑镇：位于如皋南部，镇政府驻地吴窑社区鲁班西路吴窑镇。全镇总面积64.3平方公里。