无孔类有一个只有眼晴和鼻孔的盒子般的颅骨，现存的龟类和灭绝的埋龙蜥目，前棱蜥目，锯齿龙目孔菲。
下孔类有轻巧的颅骨，眼孔鼻孔外带有额外的开孔-耳孔，包括盘龙目与兽孔类孔菲。
兽孔类是下孔类的一个分类，现存的哺乳类（哺乳目），貘头兽科，远古的二齿兽亚目，裂齿兽亚目，犬齿兽亚目均属兽孔类孔菲。
双孔类颅骨除鼻孔耳孔外，在眼孔后面有一对开口，它包括纤肢龙目，维吉梯龙科和古龙类的海龙目，原蜥类，原鳄类，引鳄科，新巴士鳄科，鳄类，鸟龙类，及调孔类孔菲。
调孔类是双孔类中的分类，它的一些开孔在陆上或水中可以调节，它包括鱼龙目，盾齿龙目，幻龙亚目，蛇颈龙亚目孔菲。
爬行纲根据颅顶孔的数目和眼窝后相互连接的颅骨的结构细分为三类：无孔亚纲；双孔亚纲和下孔亚纲孔菲。在无孔亚纲中，它们没有颅顶孔，说明了它们是最早的爬行也，说明了它们是最早的爬行动物。3亿年前最早出现的爬行纲很小，长得像蜥蜴。然而这却是很有意义，因为它们产生的爬行动物后来形成了鸟类和哺乳动物，以及在中生代时期统治地球的恐龙。
龟尽管在其它无孔亚纲灭绝后的3千万年才出现孔菲。但仍将其纳入无孔亚纲中。
兽孔类
开放分类： 生物、生物学、动物
达尔文的共同祖先理论可以应用到地球上的整个生物界孔菲。根据比较解剖学的研究，科学家推测一种生活在2亿年前的温血的两足行走的爬行动物是恐龙和鸟类的共同祖先。
爬行动物与哺乳动物之间则由一种属于似哺乳爬行类的兽孔类联系起来孔菲。兽孔类曾经在2亿5千万年前主宰地球。
按这样的方法，物种之间的联系还可以继续向更遥远的年代追溯，最后都归结到细菌孔菲。最古老的细菌化石发现在30多亿年前，是地球上发现的所有生命形式当中最为古老的。
地球上曾经存在的仍然存在的所有生命都源于同一种原始生命形态的推断在DNA中也得到了戏剧性的证实孔菲。生物化学告诉我们，各种生物的生命过程都是一样的。
兽孔类
therapsid
二叠纪和三叠纪爬虫类的一个主要目(兽孔目〔Therapsida〕)的任何成员孔菲。
兽孔类是产生哺乳类的祖先孔菲。早在石炭纪前出现了一支独特的演化线，从哺乳动物最古老的祖先盘龙目(Pelycosauria)开始，直到哺乳类，从其中的盘龙科分化出兽孔类。较晚期的类型除澳大利亚以外各个大陆都有，但在南非的晚二叠纪和早三叠纪最普通。四肢和肢带改变成四足移动。
像哺乳类那样，在头骨的顳区有一个顳孔孔菲。大多数种内，牙齿分化成像哺乳动物的门齿、短剑状的大犬齿及一系列研磨用的颊齿。然而下腭在构造上是爬虫类式的，由七块骨头组成而不是像哺乳类那样由一块组成，并具有与头骨结合的原始方式。在进步类型中，口腔顶部有一块骨质硬腭，像哺乳类那样。
著名的兽孔类旁枝是食草的二齿兽类，它们仍有上犬齿，但其他牙齿被角质喙替代了孔菲。肉食的兽孔类中，丽齿兽类和兽头类是二叠纪的代表性动物，犬齿兽类和包氏兽形类是进步的三叠纪的代表。晚三叠纪，甚至侏罗纪有一些兽孔类，但大多数到那时绝灭，或已演化为原始的哺乳类。
孔菲。
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